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島袋君惠其實是島上一係列殺人案件的真凶。
三年前，海老原壽美、黑江奈緒子和門脅紗織因為沒有拿到儒艮之箭燒了神社倉庫泄憤，殺死了在倉庫中的島袋君惠的母親，村民們為了能繼續使用長壽婆招攬遊客選擇隱瞞這件事，讓島袋君惠化妝扮演長壽婆，並且稱倉庫中的屍體是傳說中人魚的屍體。
島袋君惠為了給母親報仇策劃了一係列殺人計劃。
至於門脅弁藏隻是倒賣儒艮之箭賺取錢財，怕被誤以為是凶手才跑進森林。
至此人魚島上一些列謎團都應該已經解開了，但黑衣組織的出現使這個小島又籠罩了一層迷雲……
早川奈奈子被送去醫院，雖然還沒有蘇醒過來，但是據醫護人員所說子彈很幸運並沒有命中要害，早川警官沒有生命危險，蘇醒後正常修養就可以了。
關於這次槍的擊案，負傷的警察屬於搜查一課人員，搜查一課有心調查，但被後來的公安強勢接手。儘管目暮警部和佐藤美和子等人心懷不滿，也隻能接受上級安排指示……
“……就是這樣，灰原，關於人魚島和黑衣組織你知道什麼嗎？”柯南在回到米花町後就馬不停蹄地跑到阿笠博士家詢問灰原哀。
柯南也問過服部平次，可惜早川警官很早就察覺到危險，囑咐服部和和葉藏好找準時機逃跑，並沒有機會仔細觀察這次遇到的黑衣組織成員，沒有什麼有用的線索。
“幾年前實驗室確實安排我和琴酒去過這個小島，調查出人魚傳說都是杜撰的……後來聽說那裡的實驗室出了實驗事故……看來應該有隱情。”灰原哀記憶裡關於這個小島的線索實在是有些模糊，畢竟隻是某一次短期外派任務在調查出真相後就迅速撤離了。
柯南坐在沙發上一臉凝重：“這次早川警官和黑衣組織正麵交火應該掌握了一些重要情報，萬幸早川警官沒有丟掉性命……”
“早川警官？”
“啊，是搜查一課的新人女警，破案能力很強，這次服部和和葉能安全逃脫也都多虧了她……”，柯南想起了什麼：“性格也蠻跳脫的……”
灰原哀：“哦~大偵探對這位警官評價很高嘛，我也好想見識一下。”