隨著問題逐一得到解決，太平洋戰場上下一階段作戰行動的大概方案也確定了下來，隨即，聶人鳳親自主持了幾個重大會議，將任務落實到了各個部隊上。作為甘永興的主要助手，談仁皓參加了大部分的會議。與他預料的並不完全一樣，在確定具體的戰役任務的時候，校長還根據實際情況做出了細節上的調整。
第四特混艦隊仍然被繼續留在了中太平洋戰場上，黃曉天也得到了正式任命，在西南太平洋上出現重大轉折之前，隻有第四特混艦隊在中太平洋上迎戰美軍第五艦隊。而黃曉天的首要任務是確保能夠堅持到八月底，而在此之前，第四特混艦隊將儘量避免與第五艦隊決戰。廖漢翔作為太平洋戰區司令官，全力配合與支持第四特混艦隊。
在會議期間，聶人鳳與甘永興都單獨找過黃曉天，向黃曉天闡述了第四特混艦隊的任務重點。與談仁皓所說的一樣，第四特混艦隊的主要任務就是在中太平洋上儘量多堅持一段時間，迫使美軍把第五艦隊留在中太平洋上，而不是派往西南太平洋。為了達到這個目的，僅僅隻有第四特混艦隊是不夠的。因此，廖漢翔也有很重要的任務。即在攻打澳洲的時候，廖漢翔必須要在中太平洋上擺出進攻的姿態，對夏威夷群島東部的重要島嶼構成直接威脅，以此迫使美軍將第五艦隊留下。
相關的戰役部署是，第四特混艦隊將在中太平洋戰場上自由活動，機動巡邏海域從中途島到馬裡亞納群島，而具體的行動將由黃曉天自行確定。廖漢翔則在加德納島，萊桑島加強陸戰隊的部署，同時加強對考愛島等島嶼的轟炸。登陸艦隊將在中途島集結，而為陸戰隊提供作戰物資的運輸船隊則留在阿普拉港。這隻是進攻態勢，而不是真正地進攻，隻有在澳洲大陸上的戰鬥取得了決定性的勝利之後，廖漢翔才能夠啟動攻打夏威夷群島東部島嶼的作戰行動。
整個戰役的重點仍然在西南太平洋上。顏國忠仍然負責進攻澳洲大陸地總體指揮工作，雷少卿為戰區艦隊司令官，袁野為陸戰隊司令官，古迅雷為陸軍參戰部隊司令官，其他的司令官也得到了確認。最為重要的就是雷少卿的職權範圍。
在登陸階段的作戰行動中，雷少卿所負責的艦隊指揮工作是相當有限地。各特混艦隊仍然由艦隊司令官指揮，而雷少卿能夠直接指揮的隻有得到了加強的西南太平洋戰區艦隊，而該艦隊的主要任務就是為陸戰隊提供直接火力支援，是除陸戰隊登陸艦隊所配屬地火力支援船隊之外。能夠為陸戰隊提供直接火力支援的唯一部隊。另外，雷少卿還將負責調配各特混艦隊的行動，協調艦隊與其他部隊的行動，負責安排特混艦隊的補給工作等等。也就是說，在很大的程度上，雷少卿實際上隻是各特混艦隊的後勤保障司令官，對特混艦隊的行動沒有直接指揮權。
在當時，這個安排也是比較合理的，特混艦隊仍然是帝國海軍的主力作戰部隊，在指揮體係沒有調整過來之前，戰區艦隊司令官的權力如果太大的話，反而會影響到特混艦隊的作戰行動，另外，雷少卿在後方也無法指揮特混艦隊，這個事實必須得承認，而由他來調配各特混艦隊的作戰行動，實際上就已經給了他足夠巨大的權力了。從指揮體係上看。雷少卿地地位已經得到了承認，在整個作戰行動中，是由他來指揮特混艦隊的司令官，並且負責協助特混艦隊的作戰行動，而不是由特混艦隊的司令官向他發號施令。僅此一點，就讓雷少卿有了足夠巨大的權力。
艦隊的編製也做了一定的調整。第一特混艦隊，第二特混艦隊與第五特混艦隊都被增強為三航母特混艦隊，這是當時的指揮係統下最強大地編製了。而且三支特混艦隊的護航戰艦都是按照最大程度編製地，除了第二特混艦隊暫時無單獨的炮擊編隊之外。第一特混艦隊與第五特混艦隊都有單獨的炮擊編隊。
第三特混艦隊的變化是最大的，原先計劃在第三特混艦隊返回後被派往南大西洋戰區的四艘戰列艦以及配套的巡洋艦，驅逐艦都被留了下來。這些戰艦除了部分巡洋艦被編入了第一特混艦隊與第五特混艦隊的炮擊編隊之外，其他的全都臨時編入了第三特混艦隊，由常薦新負責指揮。而第三特混艦隊是當時最強大的炮擊編隊，而其主要任務就是在近距離上為陸戰隊提供炮火支援。
戰區艦隊的編製也發生了變化，原本隸屬於太平洋戰區的戰區艦隊被派到了西南太平洋戰場上來，與西南太平洋戰區艦隊合編為一支艦隊，該艦隊裡的六艘小型航母被分成了兩個獨立的航母戰鬥群，在作戰中，該艦隊的任務仍然是為陸戰隊提供支援，而兩個小型航母戰鬥群將輪番上陣，以保證能夠持續不斷的為陸戰隊提供支持。
陸戰隊的登陸艦隊也做了相應的調整，最大的變化是，剛剛服役的那批新建造的護航航母將全部編入陸戰隊登陸艦隊的火力支援艦群裡麵，而且配屬了直接隸屬於陸戰隊指揮的航空兵（之前，陸戰隊並無單獨的航空兵）。而該艦群除了為陸戰隊提供支持之外，還有一個重要任務，那就是在必要的時候，承擔起為特混艦隊以及戰區艦隊運送作戰飛機的任務。
地麵作戰部隊方麵，陸戰隊與陸軍作戰部隊都做了相應的調整。
顏國忠組織了至少30個陸戰師，而這些陸戰師的任務是負責登陸，奪取登陸場，並且鞏固登陸場。也就是說，在登陸作戰中，陸戰隊將承擔起所有的任務。陸軍參戰部隊並不參加登陸作戰，而是在陸戰隊上岸，並且建立起了登陸場之後，陸軍參戰部隊才會踏上澳洲大陸，頂替陸戰隊。負責發動大規模進攻。
這30個陸戰師被編為了陸戰隊第一集團軍群，由袁野少將（已經確定將會晉升為中將）擔任司令官。而該集團軍群又被編成了，“甲”，“乙”，“丙”三個集團軍，其中“甲”集團軍有8個陸戰師，其中有6個主力陸戰師。其任務為負責搶灘登陸，並且在隨後的行動中拓展登陸場，掩護其他部隊上岸。“乙”集團軍編有12個陸戰師，其中有4個主力陸戰師。主要任務是承擔第二輪進攻行動，打通幾個登陸場之間的聯係，拓展登陸場的縱深，在陸軍參戰部隊上岸之前，負責向美軍防線縱深發動進攻。“丙”集團軍編有10個陸戰師，其中有4個主力陸戰師，這是整個戰役地預備隊，如果前期作戰順利的話，“丙”集團軍將在隨後的作戰行動中與陸軍參戰部隊配合。一起攻打悉尼港。而“丙”集團軍的編製並不固定，在作戰時，可以根據實際的情況，從另外兩個集團軍中抽調部分部隊進行加強，以增強其進攻能力。
在整個作戰安排中，古迅雷指揮地陸軍參戰部隊是地麵進攻的主力部隊。而在會議中。古迅雷已經做出了保證，在六月中旬的時候，他手下的兩個坦克師，以及新編製的炮兵師都將完成訓練與整編工作，而且將在地麵作戰中發揮最重要的作用。
從整個登陸戰役計劃來看，陸軍參戰部隊地任務比重大概占到了一半，而且其主要任務就是在上岸後奪取悉尼，為後繼部隊。以及運輸船隊提供理想的上岸地點。實際上，奪取悉尼是整個澳洲戰役的分水嶺。在此之前為登陸作戰階段，而隻要奪取了悉尼，那麼就將進入到地麵作戰階段。
最初，顏國忠並沒有計劃讓陸軍參戰部隊在此之前上岸，認為陸戰隊有足夠的能力打下悉尼，可在確定具體地戰役計劃時，顏國忠做出了讓步。當時，已經有跡象表明，美軍正在加強悉尼的防禦，雖然增派到悉尼的美軍並不是很多，美軍的主力仍然留在了布裡斯班，但是隨著悉尼防禦力量的增強，如果僅憑陸戰隊的力量攻打悉尼的話，恐怕就得花上更多的時間了。另外，為了將美軍第五艦隊牽製在中太平洋上，廖漢翔需要更多的陸戰隊在前線擺出進攻地態勢來，因此不得不將原本應該用到西南太平洋戰場上的10個陸戰師投入到了中太平洋戰場上去，這更迫使顏國忠考慮讓陸軍來承擔起進攻悉尼的重任了。