這部分長度大約1500nt,不同物種略有差異,算是目前主流的九大新物檢測步驟之一。
五分鐘後。
裘生抬起頭,對徐雲道:
“老徐,準備好了,引物你覺得用啥?”
徐雲想了想,很快道:
“1492r吧。”
“好嘞!”
半個小時後。
裘生抬起頭,打了個響指:
“搞定,擴出來了,bast的密匙你有吧?”
徐雲朝他豎起一根大拇指示意乾得漂亮,隨後走到操作台邊,劈裡啪啦的輸了一大串密匙。
做過新種檢測的同學應該都知道。
16s相似度檢測的界限其實有些模糊,因為不同分類群的檢測相似度閾值是不一樣的。
比如有的是97,有的是99。
隻是在通常情況下。
相似度超過97的,就可以認為是一個物種。
相似度低於97的,就可以認為是不同物種,進行下一階段檢測。
不過就是這樣一種不太精細的檢測手段,卻依舊是很多新物檢測邁不過去的一道坎:
大部分樣本在經過檢測之後,都會發現相似度在99.99以上,與其他某某微生物是同一物種。
總而言之。
這項技術在定屬方麵還是靠譜的。
又過了一會兒。
裘生一臉驚喜的抬起頭,聲音驟然拔高了幾分:
“老徐,相似度46.9,46.9!!”
“毫無疑問,這是一類新物!”
徐雲認真的看了他一眼,確認道:
“隻有一種新物嗎?”
“沒錯,隻有一種!”
徐雲若有所思的點點頭,又道:
“那就繼續上磷脂脂肪酸和呼吸醌鑒定吧。”
眾所周知。
新物鑒定一般都有九個流程:
1、16s相似度。
2、形態學觀察。
比如這個菌的形狀、大小、鞭毛情況等等,還包括最適生長條件的確定。
3、磷脂脂肪酸鑒定,這個具有屬特異性。
4、呼吸醌,也就是看一下占優勢的呼吸醌是哪種,這個有種特異性。
5、分子雜交,也就是測定基因組序列,草圖就行,然後跟近源物種去比較。
相似度超過70是一個種,低於70是不同物種。
6、碳源利用情況,看一下能利用哪些碳源,一共有95種碳源的測試。
7、api試劑盒鑒定,生理生化鑒定的一方麵。
8、gc含量。
9、革蘭氏染色。
大概經過這些方麵的檢查,就可以確定是不是新種了。注:不知道這樣寫的比較詳細大家願不願意看?這種詳細流程應該沒有其他書寫過,找人問其實很麻煩的,要是還被嫌水下次我就不寫了)
其中第五個流程,也就是分子雜交這次可以直接忽略——畢竟第一部測出來的46.9實在是差距太明顯了。
考慮到時間問題,徐雲將幾個步驟逐一分工,由幾位工具人...咳咳,課題組成員同步進行。
五個小時後。
一道最終報告出爐了。
“節叢孢屬的一類全新微生物,1000倍油鏡下可觀察到形態,體外具備大量假絲。”
“這種假絲可以分離,與目標結合完成某種化合反應,這是...禿頭攻擊?”
“一片青苔中可以高密度富集8000單位的極少量新物,特性上與嗜酸乳杆菌有一定類似...嗯?”
隨後看著其中的一欄報告,徐雲有些疑惑的抬起頭,對裘生問道:
“老裘,新物對食物殘渣的淨化效果最為明顯?”
裘生點了點頭,指著不遠處的一個培養皿道:
“經過我們的初步檢測,這種新型微生物可以有效遏製殘渣中氨氣、有機酸和硫化物的生成。”
“並且對奈瑟氏菌和厭氧鏈球菌之類的細菌,有著極強的殺傷力。”
徐雲微微一愣:
“奈瑟氏菌和厭氧鏈球菌?”
不過很快,他便反應了過來:
這兩種細菌,都是人體唾液和牙齦的標準分泌物之一:
每一毫升的普通唾液裡可以尋找出奈瑟氏菌8000萬個,在每一克牙齦分泌物中更是可以尋找出10億個厭氧鏈球菌。
在食堂裡吐出骨頭啦、吐出西紅柿皮啦、吐出半截蛆蟲時沾染上這些細菌,最後流入下水管道是很正常的事情。
接著徐雲指著報告,對裘生說道:
“老裘,新種隻對食物殘渣和唾液細菌有效嗎?”
裘生沉吟片刻,答道:
“準確的說,新種對於其他一些臭味源也有一定的扼製作用,但效果都遠不如食物殘渣和唾液細菌。”
徐雲疑惑的看了他一眼,問道:
“其他臭味源,都有哪些?”
裘生立時掰持起了手指:
“廁所裡的小八小漢堡,還有小李找他室友要來的一小片兩個禮拜沒洗的臭襪子,還有.......”
“停停停,打住打住!”
徐雲額頭頓時冒出了一股黑線,連忙止住了裘生的描述。
隨後他強迫自己平複了一番心情,繼續道:
“得,你乾脆直接報數據吧。”
裘生很是惡趣味的一笑,又從桌上拿起了另一份報告:
“比起其他臭味源,新種對於食物殘渣和唾液細菌的效果簡直可以用逆天來形容。”
“比如我們富集到的一個新種植株,生物效能才8000單位,小的可憐。”
“可它將一塊0.3立方厘米大小的食物殘渣徹底淨化乾淨的時間,前後也不過二十分鐘罷了。”
說著說著,裘生不由在徐雲麵前比劃了個8的手勢:
“這才8000單位啊,你看現在青黴素的單位,哪個不是百萬級起步?”
“老徐,你知道這意味著什麼嗎?”
徐雲沉默片刻,隨後眉頭一掀:
“代表著......你的口臭有救了?”
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