小剛將即將要發生的事情全部告知了達摩斯，達摩斯道“原來如此！你們從未來而來不就是想要將真正生命寶玉歸還給阿爾宙斯嗎？我現在隻知道生命寶玉在奇辛的手裡，剩下的就”
“當時米季納的土地受到了嚴重的損傷，是阿爾宙斯的幫助才讓這片土地變得富饒。我怎麼可能會傷害我們的恩人呢！”
小智道“達摩斯先生，你擁有超克之力對吧！現在請讓我們助你一臂之力，奪回生命寶玉。”
希娜還是太單純了，三言兩語就被奇辛誆騙，奇辛給了希娜假的生命寶玉讓她去歸還，小智用達克萊伊的黑洞將人一路放倒，來到了之前的那座大殿裡。
日蝕開始了，希娜拿著權杖來到了阿爾宙斯麵前，希娜道“我是希娜，我來歸還生命寶玉。”
阿爾宙斯問道“達摩斯呢？”
希娜道“達摩斯準備背叛你，所以就由我來歸還！”
一旁的達摩斯扶額道“小智這就是我的後代嗎？真是天真的可以！”
小智無奈道“我也沒有想到希娜小姐這麼容易就相信了奇辛。”
希娜將權杖遞給阿爾宙斯的時候，裡麵居然是空的。奇辛一聲令下，電係寶可夢們同時使用了電係的絕招。
阿爾宙斯憤怒道“你竟然敢欺騙我！”
“倒下銀之水！”
銀色的液體從四麵八方湧出，阿爾宙斯被液體擊中落入了大殿的地下牢籠中，銀色的液體瞬間凝固困住了阿爾宙斯的腳，限製住了它的行動，電係絕招再次攻向阿爾宙斯。阿爾宙斯發出痛苦的叫聲。
奇辛從懷中拿出了生命寶玉，對希娜道“希娜小姐，生命寶玉是不可能還給阿爾宙斯的！”
希娜才明白她被騙了，道“你一直都在騙我對吧！”
奇辛笑道“我還要感謝你告訴我未來發生的事情。多虧你，未來才能改變！”
奇辛想要將希娜也一起用銀之水毀滅，千鈞一發之際，達摩斯拉住了希娜的手，救了她。希娜與達摩斯的超克之力交彙，才知道了她誤會了達摩斯。希娜自責道“我闖下了大禍！”
達摩斯道“這件事總要有人去做，說到錯要是我一開始就發現奇辛的野心，也不會這樣。小智已經去搶回生命寶玉了！”
小智道“夢幻，精神強念，皮卡丘，鐵尾！”
皮卡丘的鐵尾直接就將青銅鐘給廢了，夢幻使用精神強念與席多藍恩纏鬥了起來，皮卡丘解決完了青銅鐘後，就加入了夢幻的戰局，冠軍級的皮卡丘與神獸級的夢幻聯手，也夠席多藍恩喝一壺的了。
“皮卡丘，十萬伏特，夢幻，水炮！”
兩隻的絕招完全壓製住了席多藍恩的熔岩風暴，夢幻進接著用精神強念使得席多藍恩失去了戰鬥能力。神出鬼沒的夢幻身影，將奇辛手裡的生命寶玉拿到了小智手裡，小智將其放進係統空間裡。
奇辛激動道“還給我！你們不能將生命寶玉還給阿爾宙斯！”但他的行動被夢幻完全控製住了。
小智道“生命寶玉本來就是阿爾宙斯的東西，不是你的！”
奇辛道“我這麼做都是為了米季納！失去生命寶玉，這裡將會再次變得荒蕪！未來也將什麼都沒有！”
小智道“你真以為這所謂的銀之水就能殺死阿爾宙斯嗎？那我明確的告訴你，阿爾宙斯是神明中的神明，生命寶玉隻是輔助，想要殺死它銀之水恐怕還不夠資格。而且真正使得米季納變為富饒之地的是你們，是你們的辛勤耕耘。為了私心就想要占據生命寶玉，你今日的所作所為會給未來的人帶來多大的災害你明白嗎？”
小智將奇辛直接交給了達摩斯，相信他會給奇辛一個處置的結果的。
小剛與小光也成功破壞了銀之水注入的裝置，夢幻的精神強念將阿爾宙斯救了出來，小智將生命寶玉也歸還給了阿爾宙斯。重新恢複力量的阿爾宙斯，道“少年，你叫小智對吧！真是非常感謝你！”
日全食之日，阿爾宙斯如期降臨，達摩斯也按照約定將生命寶玉重新歸還給了阿爾宙斯。達摩斯和希娜共同使用了超克之力，將事情整個告知了阿爾宙斯。
阿爾宙斯道“達摩斯，希娜你們的想法已經傳達給我了！沒關係的！”
此時日全食已經過去了，生命寶玉的光芒重新化為了阿爾宙斯的五個生命之源，重新融入了阿爾宙斯的體內。
阿爾宙斯恢複了力量，但曆史的原因還是使得它陷入了沉睡。阿爾宙斯回到了它自己的空間裡，小智它們也在達摩斯的送彆下回到了原來的空間。
達摩斯在眾人臨行前，跟他們保證道“小智、小光、小剛、希娜，你們放心，未來的米季納隻會更加富饒。”
小智四人回到了現實，此時的米季納已經恢複了沒有被阿爾宙斯的製裁光礫破壞前的樣子，被眾神獸圍著的阿爾宙斯也停下來了動作。阿爾宙斯看向了小智道“曆史得到了修複！好久不見，小智！你們的世界真是一個美麗的地方！”
小智道“是我們的世界！”
阿爾宙斯笑道“我都忘記了，我也是這個世界的一份子！”
小智見阿爾宙斯想起了千年前的記憶，就把自己的寶可夢們收進了精靈球裡。整個米季納如達摩斯說得那樣，變得更加繁榮富饒了！米季納變得富饒，依靠的還是人類與寶可夢的共同努力。
賓客找到了小智四人，他與希娜興奮的抱在一起，小剛的心徹底碎了！
時空三神也各自回到了各自的空間中，眾人再次目送阿爾宙斯遠去。米季納遺跡中多出了一塊石碑，上麵畫著的正是小智四人、達摩斯與阿爾宙斯。
小光道“大家來看，這裡多了一個石碑。上麵畫的是我們哎！”
希娜看著石碑上的字翻譯道“教導何為信賴之心的未來的孩子們啊，希望米季納的未來會成為一個更美好的地方，我會永遠為你們祈禱，你們所處的未來是什麼樣的地方呢？”
希娜感動道“達摩斯先生！”
【完成劇情任務超克的時空，獎勵積分】
小光為了參加睡蓮鎮舉辦的華麗大賽，一行人再次踏上了旅程。
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