魏學曾，字惟貫，號確庵，涇陽人，明朝大臣、學者。曆任戶部郎中、右僉都禦史、遼東巡撫、右副都禦史、吏部左侍郎等職。在遼東時，討平嘩變、抵禦蒙古，又厘治屯田。內閣首輔張居正主政後，魏學曾因與其不和，被貶回鄉。張居正死後，改以南京戶部尚書致仕，受命為兵部尚書兼右副都禦史，總督四鎮軍務。一意主戰，派兵擊殺河套回部首領唐兀·明安，獲授太子太保。寧夏之役時，調集大軍進剿哱拜，直抵寧夏城下，並製定決河灌城的計策，後因應變不力而遭監軍梅國楨等彈劾，被逮至北京，戰後經朝臣申冤，得以複職致仕，去世年七十二，追諡“恭襄”。
魏學曾，十四歲時為紫陽諸生，參加陝西鄉試，中舉人，登進士第，釋褐任戶部浙江司主事，升任戶部員外郎、戶部郎中。當時，有宦官為商人請求支取上萬兩糧草銀，因魏學曾堅決反對而作罷，之後升為光祿少卿，又升都察院右僉都禦史、巡撫遼東。在遼東任職時，士兵黃勇作亂，魏學曾用計將其擒獲。
隆慶初年，蒙古察哈爾部大舉進攻永平，魏學曾進駐山海關，命王治道等諸將追擊至義院口，取得大勝，旋即升銜為都察院右副都禦史。其後，他調換將吏，招納降將，厘治屯田二千多頃，數次擊敗敵人，獲朝廷封賞。後因病離任，又被起用為兵部右侍郎，提督神樞營，旋即改任吏部左侍郎。
穆宗崩逝，大學士高拱想排擠司禮監太監馮保，囑咐禦史彈劾他，魏學曾修書大學士張居正，說“朝臣都說您與馮保有圖謀，先帝遺詔也是出自您之手。今天的事情是不應該庇護這個閹官。”張居正大怒。高拱被逐出朝廷，滿朝文武都大驚失色，唯獨魏學曾高聲地說“皇上登位伊始，就貶逐顧命大臣，詔書出自何人，不能不公開告訴百官。”他要求各位大臣到張居正的府邸爭論此事，各大臣多數不肯去，張居正也以疾病推辭諸臣來訪。
從此，魏學曾與張居正的關係更加惡劣，之後他被貶為南京右都禦史，還未上任，又被迎合張居正的給事中宗弘暹彈劾，朝廷下詔讓他以原職等候調遣，魏學曾於是回到家鄉。張居正死後一年多，魏學曾被起用為南京戶部右侍郎，又被征召為都察院右都禦史，督察倉場。不久，從南京戶部尚書任上致仕。
順義王扯力克西赴青海，火落赤、真相等部進犯洮州，臨洮副總兵李奎、李聯芳先後被殺。朝廷命戎政尚書鄭洛經略七鎮並兼任總督，鄭洛堅辭總督之職。經內閣大臣王錫爵推薦，神宗起用魏學曾為兵部尚書兼都察院右副都禦史，總督陝西、延、寧、甘肅軍務。當時，鄭洛主張議和，魏學曾到任後，與他意見不合，並得到了陝西巡撫葉夢熊的支持，二人抨擊鄭洛玩忽職守。恰好扯力克東歸，火落赤諸部也遷走，魏學曾道聽途說，上奏認為扯力克雖然歸去，暗地裡卻留了兩萬精兵在嘉峪，想幫助火落赤、真相。此言得到朝官的爭相附和，王錫爵心裡後悔，上疏奏明，又送信責備葉夢熊。兵部尚書石星認為扯力克既然東歸，宣府、大同方麵的局勢就很緊急，於是將鄭洛召回商議安撫事宜，不理魏學曾的奏疏。
不久後，河套回部首領唐兀·明安完成互市交易，要求增加賞賜，魏學曾命令總兵杜桐、神木參將張剛、孤山遊擊李紹祖出其不意將其斬殺，斬首四百五十餘級，生擒二十餘人，奪馬匹器械無數。魏學曾因功加為太子少保，而唐兀·明安之子擺言太聲言為父複仇，號召各部落，使西北地區兵端大開。
致仕寧夏副總兵哱拜反叛，殺死巡撫黨馨及副使石繼芳，逼迫總兵官張維忠自殺，其子哱承恩攻陷玉泉營、中衛、廣武，黃河以西地區望風而降，隻有平虜在參將蕭如薰堅守下堅決不降。隨後，叛軍進一步奪取了黃河以西的四十七座城堡，並且渡過了黃河，又引誘河套地區的蒙古首領著力兔歹成台吉、宰僧等部進犯平虜、花馬池，陝西全境震動。
魏學曾下令副總兵李昫率遊擊吳顯趕赴靈州，另遣遊擊趙武赴鳴沙州，沿黃河一帶阻止叛軍南渡，自己進駐花馬池，正當叛軍的衝要。李昫等渡過黃河，收複了被占領的四十七座城堡，隻有寧夏鎮城還被叛軍盤踞。著力兔等部與叛軍遙相呼應，哱拜、土文秀進攻趙武於玉泉。哱雲引導著力兔攻平虜，被蕭如薰設下埋伏射死。李昫回救趙武，成功解圍，李昫領兵與前任總兵牛秉忠抵達寧夏鎮城下。
當時，神宗已提拔董一奎為總兵，李賁為副職。不久，又命蕭如薰接替董一奎、麻貴接替李賁，二人還未到任，李昫等已經攻城。叛軍從東西二門各派驍勇善戰的騎兵三千迎戰，步兵排列火車為陣營，明軍發動進攻，奪得戰車百輛，乘勝追擊，將叛軍逼入湖內，叛軍淹死的不可勝計。次日，許朝、土文秀等叛將脅迫慶王登上東城，乞求暫時罷兵，詭稱願意獻出叛亂首領的腦袋，正好明軍糧草耗儘，於是退至附近的城堡休整。
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魏學曾日夜辦理糧草，調動延綏、莊浪、蘭、靖、榆林的部隊，道路遙遠，打造的船隻也沒有準備好，於是駐於花馬池，等部隊一到就移到靈州。很快，延綏遊擊薑顯謨、都司蕭如蕙，甘州前任總兵張傑及麻貴軍都到了，又抵達寧夏鎮城進攻。叛軍考慮到延綏、榆林的明軍出動後，城內空虛，便勾結黃台吉的妻子，命令他兒子舍達夫等人攻掠舊安邊、磚井堡以牽製明軍。哱承恩又以計謀集合叛賊兵力，埋伏在延漢渠，搶掠二百輛運糧的車子。
魏學曾從花馬池回靈州，被叛賊包圍，直至援軍抵達後才獲救，麻貴等數次攻城未能攻下，慶王妃方氏自儘，慶府的宮人、金帛被搶掠一空。朱秉忠在戰鬥中右腿負傷，於是明軍再次撤回。此時，神宗聽從兵部尚書石星的建議，賜給魏學曾尚方寶劍督戰，允許他將“違者立斬”。正好寧夏巡撫朱正色、甘肅巡撫葉夢熊、監軍禦史梅國楨，大將劉承嗣、董一奎、李如鬆先後抵達，明軍再一次攻城，仍連戰不下。
起初，魏學曾、朱正色招降叛軍大將劉東暘、許朝不成，使得所派使者葉得新罵賊遇害、曾總管寧夏軍的張傑被扣壓，神宗嚴詞責備招安的計劃。到這時，寧夏鎮城中的百戶姚欽、武生張遐嶺用箭將一信射到城外，相約為內應，半夜點火為信號。火點後，城外的官軍未到，叛賊將與姚欽同謀的五十餘人殺死，姚欽逃奔明軍大營。當時，叛軍對外假意要求撫恤以緩兵，暗地裡與盜匪勾結，然而糧食已吃完，形勢更為不利。
魏學曾與葉夢熊、梅國楨定下計策，決堤引黃河灌城。此時，河套部落的卜失免、莊禿賴率三萬騎兵進犯定邊、小鹽池，以鐵雷為前鋒，另派宰僧領一萬騎兵從花馬池以西的沙湃口進攻，聲援哱拜。麻貴在右溝成功將其阻擊，使其分路赴下馬關及鳴沙州，魏學曾命遊擊龔子敬扼守沙湃口，征延綏總兵官董一元搗毀鐵雷的巢穴，斬首一百三十餘級，河套諸部大驚而走。
在沙湃口包圍龔子敬，龔子敬戰死，但叛軍至此失去了外援。魏學曾增大壩水決口，黃河決口，大堤毀壞，又修治大堤，寧夏鎮城外水深有八、九尺，東西城崩塌百餘丈。著力兔、宰僧又進入李剛堡，被李如鬆、麻貴等擊敗並追趕至賀蘭山，叛軍更加害怕，要求和議，明軍對是和是戰懸而未決。
魏學曾招降劉東暘、許朝時，曾停駐固原十餘日等待消息，被神宗責以玩忽職守。李昫渡黃河又稍遲，使得鬆山、河套諸部先進入，明軍由是再次失利。魏學曾在平叛伊始，曾上疏要求監軍不要參與兵事，神宗命梅國楨遵守，梅國楨對此頗為不滿。其後，梅國楨彈劾諸將觀望，並定魏學曾為“玩寇”罪。給事中許子偉也彈劾魏學曾為招撫所迷惑，耽誤了國事。梅國楨又說僉事隨府從城上逃下，叛軍命令四個人下來捉拿，明軍距離咫尺卻不敢上前救援。而北邊河套諸部數萬人截斷明軍糧道，殺戮無數，魏學曾卻隱匿而不上報。神宗得報大怒，將魏學曾逮至京師，而命葉夢熊接替任職。史稱葉夢熊執行魏學曾的計劃，“遂成功”，據記載，魏學曾被捕時，朝臣數十人上疏援救，寧夏將士也“號泣送之”。
魏學曾逮捕不到一個月，寧夏城破，明軍乘勢而入，哱拜之亂平定，神宗在詔書中稱魏學曾“功魁實罪首也”，將其奪職為民，後朝廷論功，命他以原官致仕。
魏學曾任事勤勞，灌城招降的計策，本是他的建議，等到奏捷時，神宗召見大學士趙誌皋、張位，二人極力為魏學曾辯解，兵部尚書石星等朝臣多稱魏學曾無罪，梅國楨也上疏說“魏學曾應變稍慢，臣請求責備諸將是要振奮士氣，而逮捕魏學曾的命令，發自臣的上疏，臣深感悔恨。魏學曾不獲昭雪，臣將受到萬世的譏刺。”李如鬆說“魏學曾被捕時，三軍將士淚如雨下。”葉夢熊也將功勞歸於魏學曾，神宗開始不聽，後來才恢複魏學曾的官職。
魏學曾在涇陽家中去世，享年七十二歲，禦史張邦俊建議為魏學曾等十四人補諡，但未獲準，神宗賜祭四壇，“給全葬”。天啟年初，禮部左侍郎周道登奏請補上魏學曾等四十四人的“職名行實”，熹宗準奏予諡，熹宗下詔賜魏學曾諡號為“恭襄”。
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